水箱冷凝器主要是水垢的影响。在制冷空调系统中，常采用再循环水系统。从冷凝器来的温水经管道送入冷却塔，水在冷却塔降温后由水泵送入冷凝器中循环使用。水垢是由碳酸氢盐的热分解所产生的溶解性很低的碳酸盐(主要是钙盐和镁盐)形成的。对于长期使用的水冷式冷凝器，其管内会产生很厚的水垢，严重影响冷凝器的换热效果，导致冷凝压力上升。因此对保温水箱里面的水垢应加以清除。对于冷凝器及水箱中的水垢常采用化学法清除。除垢剂一般有固体除垢剂和液体除垢剂两种。
1.确定系统所存的水量，计算出所需化学除垢剂药品的数。
2.按照除垢剂配料标准进行备料。使用固体除垢剂先要在水桶中搅拌，使其完全溶解，然后加入系统中;使用液体除垢剂需加防泡剂以防止产生过多的泡沫。
3.排清集水盘中的水，彻底清除淤泥污物。
4.关闭泄水阀，注入清水，开启水泵，让水循环。
5.在水循环过程中加入除垢剂。施加除垢剂的地点可以在冷却塔的集水盘中。加入除垢剂后使系统循环运行。由于水垢多数以碳酸盐为主，因而运行这么长时间就能使水垢溶解并使系统达到所需的清洁度。保温水箱水垢清除工作结束后将废液排放到下水道，并用清水冲洗系统。